Los científicos han reconstruido los genomas de la oreja corta gigante extinta () y la oreja corta estadounidense () usando fragmentos de ADN enʋironmental del remoto Chiquihuite Caʋe en México.
Los registros fósiles son incompletos y rara vez se encuentran muchas especies de mamíferos, en particular aquellos que vivían con bajas densidades de población.
Para estas especies antiguas, la extracción de ADN destructiva de los restos fósiles tiene el potencial de revelar nuevos conocimientos sobre la evolución y la historia evolutiva; sin embargo, también causa un daño irreparable a las muestras de alto valor.
El descubrimiento de que el ADN de las últimas rotaciones de los organismos podría obtenerse directamente de los sedimentos, por lo tanto, era una gran promesa para la genética y la filogenética de las antiguas rotaciones.
Comúnmente conocido como investigación de ADN ambiental (eDNA), este enfoque se basa en la secuenciación de fragmentos de ADN derivados de células muertas, cabello, heces y orina recolectadas dentro del sedimento. .
Las técnicas estándar de eDNA permiten que la composición de las especies se determine en la presencia de macrofósiles a través de una variedad de ambientes que incluyen sedimentos, formaciones de hielo, hielo. minerales, lagos, ríos y océanos.
Sin embargo, hasta la fecha, los análisis de eDNA antiguo se han restringido a ADN mitocondrial y de cloroplasto o, más recientemente, a secuencias cortas y muy diversas generadas con una escopeta. enfoque de secuenciación.
“Cuando un animal o un ser humano orina o defeca, también se excretan células del organismo. Y los fragmentos de ADN de estas células son lo que podemos detectar en las muestras de suelo”, dijo el profesor Eѕke Willersleʋ, investigador del Departamento de Zoología de la Universidad de CA. puente y el Centro de Geogenética de la Fundación Lundletck en la Universidad de Copenhague.
“Usando técnicas de secuenciación extremadamente potentes, reconstruimos los genomas (perfiles genéticos) basados en estos fragmentos por primera vez”.
“Hemos demostrado que el cabello, la orina y las heces son todo un material genético que, en las condiciones adecuadas, puede durar mucho más de 10.000 años”.
En el estudio, el profesor Willersleʋ y sus colegas recuperaron datos antiguos de todo el genoma de 16.000 a 14.000 años de antigüedad en edificios de Chіquihuіte Caʋe en A. Cerros de Stillero, México.
Su análisis muestra que la población lack lar del Pleistoceno tardío en México está ancestralmente relacionada con la actual población lack lar de América del Este, y que la extinta g Las lágrimas de rostro corto presentes en México eran profundamente diferentes de la anterior legislación de Beringia.
“Las orejas cortas que vivían en el norte de México eran claramente diferentes de la población de orejas cortas que vivían en el noroeste de Canadá”, dijo el Dr. Mіkkel Wіnther Pedersen, investigador del Centro de Geogenética de la Fundación Lundletck en el Instituto GLOBE de la Universidad. de Copenhague.
“Este es un excelente ejemplo del nuevo conocimiento que de repente se obtiene cuando se reconstruyen los genomas basados en fragmentos de eDNA extraídos del suelo”.
“En todo el mundo, todos los que están científicamente involucrados en el estudio del ADN antiguo reconocieron la necesidad de reconstruir los genomas a partir de fragmentos que se encuentran en el aceite o en los sedimentos”, dijo el profesor Willersle.
“Ser capaz de hacer eso por primera vez significa que hemos abierto una nueva frontera”.
“El análisis del ADN encontrado en el aceite podría tener el potencial de ampliar la narración de todo, desde la evolución de la especie hasta los cambios en el cambio climático: esta es la tierra lunar El desarrollo de la genómica porque los fósiles ya no serán necesarios”.
